<광주 서구 농성동 시대>
- 1953. 4. : 전라남도가축위생시험소 설치(광주시 서구 농성동)
- 1962. 4. : 가축보건소로 명칭 변경
- 1973. 4. : 동부지소 설치(순천시 가곡동 974-1)
- 1980. 5. : 남부지소 설치(강진군 강진읍 서성리 71)
- 1981. 9. : 가축위생시험소로 명칭 변경
<광주 광산구 복룡동 시대>
- 1988. 8. : 본소 청사 이전(광주광역시 광산구 복룡동 89-5)
- 1990. 7. : 서부지소 설치(함평군 학교면 월산리)
- 1993. 12. : 중부지소 설치(보성군 보성읍 보성리)
- 1996. 1. : 축산기술연구소 설치(가축위생시험소 본소 + 종축장)
- 1998. 9. : 축산기술연구소 조직개편(4지소 → 2지소/△2지소)
- 서부지소는 본소로 통합
- 중부지소는 동부지소로 통합
- 남부지소는 민간위탁
- 1999. 5. : 남부지소 정상화
<전남 강진 시대>
- 2010. 11. : 본소 청사 이전(강진군 작천면 금강로 619)
- 2010. 11. : 서부지소 청사 신설(영광군 묘량면 밀재로 385)
- 강진군 소재 남부지소를 폐지하고 서부지소 신설
- 2011. 1. : 축산위생시험소로 명칭 변경(축산시험장 분리)
- 축산시험장(구 종축장)을 농업기술원 축산연구소로 개편
- 2013. 7. : 정밀진단과 신설(정원조정 73명→76명)
- 2014. 8. : 부서 명칭 변경 및 위생관리과 신설(정원조정 76명→79명)
- 정밀진단과 → 질병진단과로 변경
- 축산물검사과 → 축산물안전과로 변경
- 2015. 1. : 가금류 도축검사 공영화 일부시행(2개소)
- 사조화인코리아 도계장, 체리부로금계 도계장
- 2015. 7. : 가금류 도축 검사관 증원(정원조정 79명→83명)
- 2015. 12. : 기관명칭 변경(축산위생사업소→동물위생시험소)
- 동물위생시험소법(2015.6.22. 제정) 시행에 따른 기관명칭 변경
- 2016. 1. : 가금류 도축 검사관 증원(정원조정 83명→93명)
- 2016. 1. : 가금류 도축검사 공영화 전면시행
- 2016. 6. : 북부지소 설치(도 행정기구설치조례, '17.1.시행)
- 2016. 7. : 과 통합 개편(도 행정기구설치조례시행규칙, '17.1.시행)
- 위생관리과와 축산물안전과 통합 → 축산위생관리과
- 2017. 1. : 북부지소 업무개시(개소식 개최 : 2017.10.12.)
- 2017. 1. : 사업소별 급여 지급업무 폐지(도 본청으로 통합)에 따른 정원 조정(93명→92명)
- 2017. 11. : 도 본청 동물방역과 신설 및 가축방역관 증원에 따른
부서명칭 변경(동물방역과→방역관리과), 정원 조정(92명→98명)
- 2019. 7. : 전라남도 조직개편 및 정원조정
- 축산위생관리과 → 축산물위생과, 축산물안전과
- 정원조정(98명 → 97명)
